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Ubuntu(Linux)でR、Rattle、Latticistとrggobiのインストール手法
2018-05-22LinuxでRとRattleをインストール手法
データマイニング論の講義で使われているツールをLinux上でインストールする方法を
以下にまとめている。
対応システム
Ubuntu 16.04 LTS Desktop x64以上
Rバージョン： 3.5
1. 環境の準備
次のコマンドを端末上で実行する
1.1 最後にRのパッケージをインストールする
Rをインストールする為、まずRの3.5バージョンがアップロード
されているリポしトリを追加する
$ sudo add-apt-repository ppa:marutter/rrutter3.5
参照リンク https://launchpad.net/~marutter/+archive/ubuntu/rrutter3.5 (2018-05-25)
次にアップでートする
$ sudo apt-get update
c$ sudo apt-get install r-base r-base-dev
1.2 Java開発ツールをインストール
Rattleである表を生成する為には,UbuntuにJavaをインストールする必要である。
まず、そのJavaパッケージがアップロードされているリポジトリを追加する
$ sudo add-apt-repository ppa:webupd8team/java
Ubuntuをアップデートすると、Javaパッケージをインストールする
$ sudo apt-get update; sudo apt-get install oracle-java8-installer
表示されてくるインタフェースの指示を従い、インストールできれば、以下のコマンドで
確認できる。
$ javac -version
RにインストールしたJavaを認めさせる
$ R CMD javareconf
参照リンク https://medium.com/coderscorner/installing-oracle-java-8-in-ubuntu-16-10-845507b13343 2018-05-25)
1.3 他の多様な依存性をインストール手法
1.3.1 一掃で依存性をインストールする為のコマンド（もしインストール済みなら、無視されている）
$ sudo apt-get install libgtk2.0-dev libxml2-dev ggobi
1.3.2 依存性インストールの詳細：(1.3.1のコマンドが既に実行された場合は、無視しても構わない)
+ libgtk2.0-dev
RのRGtk2と言うパッけージをインストールする前に、libgtk2.0-devがUbuntuに
インストールする（もうインストールされている場合は無視されている）
$ sudo apt-get install libgtk2.0-dev
と言うコマンドを実行しないと、Rattleインストールができなくなる。
+ libxml2-dev
同様仁、Rattleをインストールできるように、Ubuntuにデフォルトにインストール
されていないlibxml2-devと言うパッケージを手動にインストールする
$ sudo apt-get install libxml2-dev
+ ggobi
RGgobiを使う為には、まずUbuntuにggobiと言うパッケージをインストールしなくては
いけない。以下のコマンドで簡単にインストールできる
$ sudo apt-get install ggobi
2. Rのパッケージ(Rattle, Latticist, RGgobi…）インストール手法
Rを実行する為のコマンド:
端末から普通のユーザーとして以下のコマンドを実行するのを勧める。
$ R
Rのインストールがうまく行った場合は、Welcomeメッセージが表示され、
以下のプロンプトが出てくる。
>
2.1 Rattleのインストール手法
RattleがRのRGtk2と言うパッケージに依存するので、まずそのパッケージをインストールする
> install.packages( “RGtk2”, “RGtk2Extras”)
R端末でRattleと言うパッケージをインストールコマンド
> install.packages( “rattle”)
2.2 Latticistのインストール手法
Latticistパッケージが非推奨になった結果、install.packages( latticist)
コマンドでインストールできなくなり、またLatticist。それで、Latticistのアーカイブされたソース
コードだけでインストールできる。
まずLatticistのソースコードをインターネットから（例えばCRAN Archiveとか…）から
ダウンロードし、保存し、保存先を覚えておく。
ダウンロードリンクの一つは:
https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/latticist/latticist_0.9-44.tar.gz
保存先の例： /home/user/latticist_0.9-44.tar.gz
次に、Rコマンドでlatticistの依存性を以下のコマンドでインストールできる
> install.packages( c( “lattice”, “latticeExtra”,”lmtest”,”vcd”,”gWidgets”,”playwith”))
最後に以前にダウンロードされたアーカイブファイルからlatticistをインストールする
> install.packages( “/home/user/latticist_0.9-44.tar.gz”,
repos=”NULL”, type=”source”)
2.3 RGgobi
1.3.2でUbuntuのggobiパッケージがインストールされており、次のRコマンドで
簡単にRggobiインストールする
> install.packages( “rggobi”)
